Initialement, à partir du 1er janvier 2015, le CEP était délivré par cinq réseaux d’opérateurs censés s’adresser indistinctement à l’ensemble des bénéficiaires. Il s’agissait de Pôle emploi, de l’Apec, des Missions locales, des Cap emploi, ainsi que des FONGECIF et des OPACIF (Uniformation était un Opacif et assurait alors ce service. Ce n’est plus le cas aujourd’hui) également chargés de gérer la mise en œuvre des Congés individuels de formation remplacés, depuis le 1er janvier 2020, par les projets de transition professionnelle déployés dans le cadre du CPF.
Portée par la loi « Avenir professionnel » du 5 septembre 2018, la dernière réforme de la formation a rebattu les cartes en réservant la prise en charge des candidats au CEP en situation de recherche d’emploi aux quatre premiers réseaux d’organismes. Désormais, les actifs en emploi, c’est-à-dire les salariés, mais aussi les travailleurs indépendants, peuvent s’adresser à de nouveaux opérateurs sélectionnés via des appels d’offres lancés par France compétences, l’établissement public assurant la régulation et le financement du système de formation professionnelle. Au passage, le CEP a été doté d’un financement dédié, ce qui n’était pas le cas précédemment.